Rustam Mahmudov a fost declarat vinovat că a tras asupra jurnalistei de opoziţie în momentul intrării în imobilul în care locuia, în timp ce Lom-Ali Gaitukaev, unchiul asasinului, a fost identificat drept organizatorul atentatului.
De asemenea, tribunalul l-a condamnat la 20 de ani de închisoare pe poliţistul Serghei Hagikurbanov, găsit vinovat pentru participare la pregătirea asasinatului.
Cei doi fraţi ai atacatorului, Ibragim şi Djabrail Mahmudov, acuzaţi că au supravegheat-o pe Anna Politkovskaia şi l-au avertizat pe fratele lor în momentul sosirii, au primit pedepse de 12, respectiv 14 ani de închisoare.
Ancheta în cazul jurnalistei Anna Politkovskaia, care le-a adus pe cele cinci persoane implicate direct în crima comisă în 2006 în faţa judecătorilor, nu a reuşit identificarea unor eventuale persoane care să fi comandat asasinatul.
În 2012, fostul poliţist Dmitri Pavliuşenkov, acuzat că a localizat-o pe Anna Politkovskaia şi a furnizat arma în vederea asasinării, a fost condamnat deja la 12 ani de închisoare.
Dintre cei cinci acuzaţi, unii au fost rejudecaţi în apel după ce au fost achitaţi în primă instanţă în 2009.
Asasinarea jurnalistei de investigaţie care lucra pentru cotidianul independente Novaia Gazeta, foarte critic la adresa politicii Kremlinului în Cecenia, a provocat emoţie în lumea întreagă şi numeroase critici din partea presei străine şi a organizaţiilor pentru apărarea drepturilor omului.